Při nabídce k prodeji mohou nákladní vozy s boxovým nádržím nabízet různé možnosti ventilace. Boční a horní větrací otvory umožňují nasávět vzduch a odvádět špatný vzduch ven. Některé vozy mohou mít větrací otvory, které lze otevřít pro změnu toku vzduchu do nákladního prostoru. Za účelem přepravy vonných zboží nebo zboží, které vyžaduje cirkulaci vzduchu pro zabránění zkysnutí, lze použít ventilátory pro zlepšení distribuce vzduchu v nádrži vozu. Někdy mohou být soustavy klimatizace začleněny do systémů ventilace nejen pro chlazení, ale také pro řízení vlhkosti. Pro účely čištění a dezodorace nákladního prostoru lze montovat zařízení na čištění vzduchu, například s aktivovanými uhlíkovými filtry.